動植物調査では様々な調査方法で生育種や貴重種の分布状況、個体数等の現地調査を行います。

哺乳類目撃法、フィールドサイン法、トラップ法、コウモリ調査（バット・ディテクター）、無人撮影法等。

鳥類任意踏査法、ラインセンサス法、スポットセンサス法等。

猛禽類定点観察法、繁殖状況調査（ビデオ撮影、現地踏査）、フクロウ等夜間調査（コールバック法）。

両生類・爬虫類直接観察法等。

魚類サデ網、タモ網、投網、刺網、はえなわ、カゴ網、電気ショッカー等による採捕等。

陸上昆虫類任意採集法、ライトトラップ法（カーテン式、ボックス式）、ピットフォール法等。

底生動物定量採集法、定性採集法。

動植物プランクトンバンドーン式採水器、プランクトンネット等による採集。

付着藻類定量採取法等。

植物相、貴重植物種任意踏査法等。

植物群落Braun-Blanquet法による群落構造、種構成、被度、群度等の記載。